Marker genetyczny czyli każdy gen lub inny odcinek DNA , który może być użyty jako punkt odniesienia przy mapowaniu
innych genów . Stąd
marker genetyczny musi być łatwy do zidentyfikowania , a jego położenie na chromosomie dokładnie znane . Określenie marker genetyczny stosuje się również w odniesieniu do genów ( nadający łatwe do zidentyfikowania fenotypy ) , które są wprowadzane do określonej komórki aby ją wyróżnić spośród innych , a przez to umożliwić prześledzenie jej losów , na przykład w rozwoju embrionalnym . Przykłady markerów : transformacji pozwalający na wyszukanie komórek bakterii zawierających wektor genetyczny . Markery genetyczne znajdują też zastosowanie do identyfikowania osób lub osobników zwierząt czy roślin , identyfikowania gatunków i szczepów drobnoustrojów .