W czasie wakacji Harrego odwiedza skrzat domowy, który jest znany pod imieniem ZGREDEK. Ostrzega on Harrego przed powrotem
do Hogwartu, gdyż grozi mu tam niechybna śmierć. Niestety Zgredek sprawił, że Harry po jego wizycie miał kłótnie z ciotką i wujem. Znowu zarobił kare, gdyż przeszkodził wujowi zawrzec umowy z pewnym panem(wuj Vernon produkuje świdry). Wujostwo więzi Harrego. Zamyka go w pokoju " o chlebie i wodzie", w oknie wuj Vernon założył kraty tak żeby nie mogł uciec przez okno a drzwi do jego pokoju były otwierane gdy dawali mu jedzenie i pozwalali wyjsc do łazienki i skorzystać z toalety. Z opresji Harrego ratuje jego przyjaciel Ron i jego bracia Fred i George. Uciekają latającym samochodem(fordem Anglia, którzy bliźniaki i Ron pożyczyli od ich ojca bez jego zgody). Tak więc reszte wakacji Harry spędza u Rona w jego domu który nazywają NORA. 1 września będąc na Stacji King''s Cross barierka przeprowadzająca uczniów Hogwartu na peron nr dziewięć i trzy czwarte nie chce ich przepuścić( okazuje
sie że za tym wszystkim stoi Zgredek). Ron i Harry lecą do Hogwartu samochdem. Niestety w trakcie podrózy kończy im się paliwo i uderzają w Wierzbę Bijącą. Dostają za to szlaban. Bedąc kilka dni w szkole zaczynają się dziać dziwne rzeczy np: ktoś otwarł Komnatę Tajemnic(legendarna Komnata stwozona przez Slitherina założyciela Hogwartu. W Komnacie jest ukryty potwór- póxniej okazuje się że był to Bazyliszek- krół węży), ktoś petryfikuje kotke woźnego, zabija koguty Hagrida, petryfikuje Kolinai i jednego ducha Hogwartu Prwaie Bezgłowego Nika. Nowy nauczyciel Hogwartu Lochart( nie lubiany przez nauczycieli i przez niektórych uczniów) jest bardzo pewny siebie i wszystkim mówi że wie gdzie ów ta Komnata jest. Harry poznaje Jęcząca Marte i razem z przyjaciółmi robią eliksir wielosokowy by wydrzeć prawdę z Dracona Malfoja(podejrzewają go o te ataki). Ale okazuje sie że jest nie winny. Harry, Ron, i Hermiona wiedza ze Hagrid był wyrzucony z Hogwartu na 3 roku ale z niewiadomej przyczyny podejrzewają go tak samo jak ministerstwo. Gdy go odwiedzają, ukrywają sie pod peleryna niewidka gdyz przyszedl do niego Dumbledore Lucjusz Malfoy i miniester magii. Aresztuja Dumbledora i Hagrida, a Hagrid daje im rade by szli za pajakami. W tym czasie Hermiona zostaje zaatakowana. Chłopcy postanawiaja wyruszyc do zakazanego Lasu i tam trafiaja na slad Aragoga- pajaka Hagrida, który mowi im że Hagrid zostałoskarzony i jest nie winny. Mówi im że to co wszystkich atakuje jest w zamku i oni sie tego boja najbardziej a ten potwor boi sie piania koguta co jest dla niego zgubne. Harry bedac u hermiony ze potwor który jest w komnacie to Bazyliszek i układają w całość układanke. Siostra Rona zostaje porwana przez Dziedzica Slitherina do Komnaty a nauczyciele zlecają Lokhartowi uratowanie jej a sami mysla o zamknieciu szkoly i wyslaniu uczniow do domu. Harry i Ron ida na ratunek Ginny-siostrze Rona. "Porywają"Lokharta i ida do łazienki dziewczyn do Jęczącej Marty gdyz dowiedzieli sie ze ostatnim razem 50 lat temu gdy Komnata była otwarta ona umarła. Dowiadują sie od niej że wejscie do Komnaty Tajemnic jest w jej łazience. Wchodza tam razem z Lokhartem ale na dole robi sie zamieszanie. Lokhart atakuje ich zlamana różdżka Rona i chce in zmodyfikowac pamiec. To mu sie nie udaje. Różdżka wypaliła do tyłu i ugodziła w niego, sam stracił pamięć. Tunel zawalił się. Harry idze na przód. Na końcu tunelu spotyka lezace na podłodze Ginny ducha Toma Riddla(znalazł jego dziennik w łazience Marty i pisał do niego i w ten sposób dowiedział się o Hagridzie. Ten dziennik porwała Ginny i w nim pisała i to spowodowało ze Harry widział ducha Toma R. gdyż dziennik byl zaczarowany). Tom R. mówi mu że jest Lordem Voldemortem. Wezwał Bazyliszka i zaatakował Harrego. W tym czasie przyleciał feniks Dumbledora Fawkes i przyniósł Harremu tiare przydziału. Harry walczy z Bazyliszkem. Wyciaga z Tiary miecz Godryka Griffindora i zabija Bazyliszka, sam zostaje ranny ale ratuje go fenikgdyż łzy feniksa mają uzdrawiającą moc. Harry znajduje dziennik i wbija kieł Bazyliszka w dziennik. W ten sposób wygrywa znowu bitwe z Lordem Voldemortem, ratuje Ginny i wszyscy wracają do Hogwartu. Bedac w Hogwarcie idzie do gabinetu profesor Maggonagal i tam spotyka rodziców Rona i Dumbledora.W ostatni dzień roku szkolnego Griffindor zdobywa puchar domów i Harry znowu wraca na lato do swego wujostwa.